一、病理檢查
主要為角化不全棘層高度肥厚，乳頭瘤樣增生，表皮突增厚延長，其增生程度可似假性上皮瘤樣。刺細胞和基底細胞并有相當數量的核分裂頗似癌變。但細胞排列規則，且增生上皮和真皮之間界限清楚其特點為粒層和刺層上部細胞有明顯的空泡形成。此種空泡細胞較正常大，胞漿著色淡中央有大而圓，深嗜堿性的核。通常真皮水腫毛細血管擴張以及周圍較致密的慢性炎性浸潤。Bushke-loewetein巨大型尖銳濕疣，表皮極度向下生長代替了其下面的組織、易與鱗狀細胞相混，故須多次活檢若有緩慢發展之傾向， 則為一種低度惡變的過程，即所謂疣狀癌
二 免疫組織學檢查
常用過氧化物酶抗過氧化物酶方法(即PAP)顯示濕疣內的病毒蛋白，以證明疣損害中有病毒抗原。HPV蛋白陽性時尖銳濕疣的淺表上皮細胞內可出現淡紅色的弱陽性反應。
三 組織化學檢查
取少量病損組織制成涂片用特異抗人類乳頭瘤病毒的抗體作染色。如病損中有病毒抗原，則抗原抗體結合在過氧化物酶抗過氧化物酶(PAP)方法中，核可被染成紅色。此法特異性強且較迅速對診斷有幫助。
四 醋酸白試驗
用3-5%醋酸外涂疣體2-5分鐘病灶部位變白稍隆起，肛門病損可能需要15分鐘。本試驗的原理是蛋白質與酸凝固變白的結果HPV感染細胞產生的角蛋白與正常的未感染上皮細胞產生的不同，只有前者才能被醋酸脫色。醋酸白試驗檢測HPV的敏感性很高它比常規檢測觀察組織學變化還好。但偶爾在上皮增厚或外傷擦破病例中出現假陽性、假陽性變白跡象顯得界限不清和不規則美國CDC提示，醋酸白試驗并不是特異試驗，且假陽性較常見
五 基因診斷
迄今HPV難于用傳統的病毒培養及血清學技術檢測，主要實驗診斷技術是核酸雜交。近年來發展的PCR方法具有特異敏感、簡便、快速等優點為HPV檢測開辟了新途徑。
“病毒干擾療法”是目前有效治療泌尿感染的優秀技術。該技術可主動阻斷病毒的整合程序，防止病毒的繁殖復制，在短期內將人體內的免疫復合毒素全部清除，同時讓健康的細胞不再受到感染。這些技術是目前國際上治療泌尿生殖感染療效較佳復發率極低的治療方法，目前已成功治愈數萬名患者。