兒童癲癇的診斷方法有很多，但是如果懷疑是癲癇病，就一定要按照科學的流程進行診斷，如果兒童癲癇造成了誤診會給孩子帶來非常大的危害，北京軍海醫院的專家安曉光說：兒童癲癇的診斷注意事項有很多，在診斷癲癇的過程中一定要引起注意，不要造成誤診。
一、鑒別是否為癲癇，深睡中患兒突然坐起哭叫，表情驚恐，伴有瞳孔散大、出汗、呼吸急促等交感神經興奮表現，不易喚醒。數分鐘后即再度安靜入睡。次日對發作無記憶。根據其發作的自限性，EEG正常，可與癲癇病鑒別。
二、準確的病史和體征，有兩次以上的癲癇樣發作，意識喪失，四肢抽搐等等，發作史：癲癇患兒可無明顯異常體征，詳細而準確的發作史對診斷特別重要。癲癇發作應具有發作性和重復性這一基本特征。問清從先兆、發作起始到發作全過程，有無意識障礙，是局限性或是全面性發作，發作次數及持續時間，有無任何誘因，以及與睡眠關系等。
三、腦電圖，腦電圖是小兒癲癇的診斷最重要的環節，是診斷癲癇最重要的實驗室檢查，不僅對癲癇的確認，而且對臨床發作分型和轉歸分析均有重要價值。腦電圖中出現棘波、尖波、棘—慢復合波等癇樣發放波者，有利癲癇的診斷。若系癇性發作，進一步弄清是什么發作類型，抑或屬于某一特殊的癲癇綜合征;
四、兒童屏氣發作，多發生于6～18個月嬰兒。典型表現是當任何不愉快引起啼哭時，立即出現呼吸停止，青紫和全身肌張力低下。可有短暫意識障礙，一般不超過1分鐘。再現自主呼吸后隨即恢復正常。與癲癇的區別在于本病明顯以啼哭為誘因，意識喪失前先有呼吸暫停及青紫，EEG無異，隨年齡增大發作逐漸減少，5歲后不再發作。兒童期常見的睡眠障礙如夜驚、夢魘和夢游等。夜驚常見于4～7歲兒童，屬NREM期睡眠障礙。