光子治療后沒有不可逆轉的副作用，是非常安全的。醫生會根據患者不同的皮膚類型和具體需要治療的皮膚瑕疵、光老化類型、色素沉著、毛細血管擴張、皺紋、皮膚粗糙程度等，選擇有針對性的治療參數，包括能量密度、脈沖方式(單脈沖、雙脈沖、三脈沖等)、脈沖寬度、脈沖延時以及選用具有不同截止波段的濾光片來達到較好治療效果與最小的治療風險。但是和任何治療方法一樣，治療本身是具有兩面性的，儀器的性能、操作者的技能水平以及個人皮膚的差異，也有少數患者可能會產生較重的皮膚反應，比較短暫的結痂、紫癜、色素沉著或色素減退等，但其發生率低。對于人們關心的會不會使皮膚變薄和敏感這一問題，在理論上是不存在的。