乙肝病毒屬嗜肝DNA病毒科，乙型肝炎的致病機理比甲型、丙型肝炎復雜的多。

　　首先，乙肝病毒有兩層衣殼，外衣殼和內衣殼，具有多種抗原。在病毒的外衣殼上，有表面抗原HBsAg和前S1抗原、前S2抗原。在內衣殼有核心抗原HBcAg和e抗原HbeAg。各種抗原都有很強的“毒性”，能引起多種類型的損傷。但單獨只有表面抗體(抗HBs)是具有識別和清除乙肝病毒能力的抗體。

　　其次，乙肝病毒的表面抗原能刺激遏制T細胞T s增殖，增殖的T s使B細胞不能成熟為抗體。使單獨能清除乙肝病毒的表面抗體(抗HBs)始終不能產生，即抗HBs陰性。這就是乙肝表面抗原使機體產生的免疫耐受。免疫耐受的結果使自身免疫系統處在對乙肝病毒無特異性應答狀態，T細胞不能和成特異抗體HbsAb，你能清除血液中的乙肝病毒。導致乙肝病毒能不受障礙地長期重復感染、復制、釋放、再感染、再復制的病理過程。長期形成病毒血癥，這也就是乙肝難以治愈的原因之一

　　第三，乙肝病毒血癥同樣也能引起機體的免疫反應。但因病毒抗原的多樣性和個體免疫力的差異，使乙肝患者的身體反映也呈多樣性。當免疫力正常時，乙肝病毒能在病毒血癥期被阻斷感染，或形成隱性感染，最終病毒被清除。 當免疫力低下或免疫耐受時，對乙肝病毒致敏的免疫球蛋白在數量上和功能上都不足以完全清除病毒。因此，肝細胞損害持續存在，成為慢性持續性肝炎或慢性活動性肝炎，以致帶病終生。

　　第四，部分乙肝患者，由于長期受病毒刺激致使乙肝病毒的基因整合于肝細胞的DNA中，引起肝細胞突變發展成為原發性肝細胞癌。

　　乙肝病毒屬嗜肝DNA病毒科，乙型肝炎的致病機理比甲型、丙型肝炎復雜的多。