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生理性卵巢囊腫就是指卵巢內有囊性的腫物形成，可分為腫瘤性和非腫瘤性兩類。通常人們說的卵巢囊腫是指非腫瘤性的那一類。
腫瘤性卵巢囊腫
腫瘤性卵巢囊腫既然是腫瘤就有良性和惡性，囊性、實性之分，卵巢惡性腫瘤的病死率較高，居婦科腫瘤的**，因此一旦確定是卵巢腫瘤，即使是卵巢的囊性腫瘤，如漿液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、良性囊性畸胎瘤等，雖大多為良性，但有轉化為惡性的可能，因此均需早期手術切除。
非腫瘤性卵巢囊腫
非腫瘤性卵巢囊腫又稱非贅生性卵巢囊腫，大多是卵巢的功能性囊腫，包括卵泡囊腫、黃體囊腫、黃素囊腫、炎癥性卵巢囊腫、多囊卵巢以及子宮內膜異位囊腫(即卵巢巧克力囊腫。
此外，腫卵巢囊除了生理性卵巢囊腫還有：
出血性囊腫：有時濾泡囊腫及黃體囊腫生長過速，造成卵巢的組織牽扯而裂開流血。這些血液因沒有出口出去而積在卵巢里，就稱為出血性囊腫。
漿液性上皮囊腫及黏液性上皮囊腫：在觀察三個月后，仍然存在的囊腫有可能是屬于上皮卵巢囊腫，而非功能性囊腫。這是因為具有分泌功能的漿液細胞及黏液細胞在排卵后被包埋在卵巢內，不斷的分泌液體形成囊腫。這種囊腫是不會消失的，需要開刀切除。
巧克力囊腫(子宮內膜異位瘤)：是指子宮內膜異位癥長在卵巢內，在卵巢內形成大量黏稠咖啡色像巧克力狀的液體。
畸胎瘤：這是一種很特別的囊腫，可能是在胚胎時期的細胞分化上出了問題， 經過很久的時間才表現出來。它會在卵巢內生成毛發、牙齒還有一些油脂類的聚集。
卵巢：罹患卵巢*的機率相當低，但因為位于骨盆腔內，并不容易早期發現。
生理性卵巢囊腫無論是腫瘤性或者非腫瘤性，一定要引起足夠的重視，檢查出來后及早進行治療，尤其是一些未生育女性，因為生理性卵巢囊腫會導致不孕。咨詢專家如何治療生理性卵巢囊腫。
生理性卵巢囊腫的分類
生理性卵巢囊腫的分類1——腫瘤性卵巢囊腫
腫瘤性卵巢囊腫既然是腫瘤就有良性和惡性，囊性、實性之分，卵巢惡性腫瘤的病死率較高，居婦科腫瘤的**，因此一旦確定是卵巢腫瘤，即使是卵巢的囊性腫瘤，如漿液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、良性囊性畸胎瘤等，雖大多為良性，但有轉化為惡性的可能，因此均需早期手術切除。
生理性卵巢囊腫的分類2——非腫瘤性卵巢囊腫
非腫瘤性卵巢囊腫又稱非贅生性卵巢囊腫，大多是卵巢的功能性囊腫，包括卵泡囊腫、黃體囊腫、黃素囊腫、炎癥性卵巢囊腫、多囊卵巢以及子宮內膜異位囊腫(即卵巢巧克力囊腫)。