中醫學認為，任何疾病都是由于正邪斗爭的結果，生殖器皰疹也不例外。其病性早期屬熱證、實證，為濕熱、毒火阻滯肝脈;后期則伴有肝腎不足。
(1)濕熱下注：素日多食肥甘厚味、辛辣之品，或嗜煙酒，損傷脾胃，脾失健運，水濕內蘊，郁化熱，以致濕熱蘊積于下焦，注于陰部，發為生殖器皰疹。
(2)外感淫毒：淫欲過度，不潔性交，外染毒邪，蘊結于局部皮膚黏膜，則發為生殖器皰外感淫毒對發病是非常關鍵的，雖然是濕熱之體，但未有不潔性交也不會發病。
(3)腎氣不足：腎開竅于前后二陰，或由于房勞過度，或由于濕熱、淫毒久稽，耗傷腎陰;日久陰損及陽，也可造成腎陽不足。腎陰腎PEI是人體最寶貴的物質，統帥著人體全身的陰陽，當腎陰腎陽受損后，人體陰陽就會失調，疾病就容易復發。