專家分析，生殖器皰疹的癥狀表現如下：
(1)原發感染：初次感染HSV，患者體內未產生抗HSV抗體，為原發感染。原發感染潛伏期為1周左右，局部癥狀明顯，外生殖器部位發出散在疼痛性的紅斑、丘疹、群集水皰、膿皰、糜爛、潰瘍等多樣皮損，好發于龜頭、冠狀溝、包皮和陰莖皮膚，也可見于陰囊、大腿內側和臀部，伴刺癢和灼熱等不適，嚴重病例伴有發熱、頭痛、乏力、肌肉酸痛、淋巴結腫大等全身癥狀。還可伴有尿道炎癥狀。3～4周皮損結痂愈合。
(2)非原發感染：以往感染過HSV，體內已有抗體，發病輕，愈合快。但在初次感染后，體內產生的抗體不能完全清除病毒，病毒可潛伏下來長期存在，當患者免疫力降低并受到某些誘發因素影響(寒冷、勞累過度等)，則在同一部位病情復發，出疹前常有刺癢感。
(3)其他表現：男彩虹戀可有肛門直腸感染時表現為疼痛，排出炎性分泌物，里急后重，便秘，肛門直腸內可見潰瘍。孕婦感染時，可經胎盤傳染胎兒，引起畸胎、流產或死胎。