在國(guó)家863、973專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)和國(guó)家自然科學(xué)基金創(chuàng)新研究群體科學(xué)基金資助下，我院所分子腫瘤學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和病因及癌變研究室與南京醫(yī)科大學(xué)、中山大學(xué)腫瘤防治中心、北京市腫瘤防治研究所、華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院和美國(guó)國(guó)立癌癥研究院(NCI)等國(guó)內(nèi)外多家單位合作開展的食管癌全基因關(guān)聯(lián)研究再獲重要成果。一篇題為“Genome-wide　association　analyses　of　esophageal　squamous　cell　carcinoma　in　Chinese　identify　multiple　susceptibility　loci　and　gene-environment　interactions”　的研究論文于2012年9月9日在線發(fā)表在國(guó)際優(yōu)秀期刊《Nature　Genetics》。

　　該研究運(yùn)用高密度SNP芯片，在全基因組范圍檢測(cè)了大樣本量的食管癌患者和正常對(duì)照者的基因變異，并經(jīng)過(guò)多中心、大樣本量的病例-對(duì)照驗(yàn)證，發(fā)現(xiàn)5個(gè)染色體區(qū)段的7個(gè)變異(5q11的rs10052657，21q22的rs2014300，6p21的　rs10484761，10q23的rs2274223和12q24的rs11066015、rs2074356和rs11066280)與食管癌發(fā)病相關(guān)。雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)若干食管癌的易感位點(diǎn)，但這些位點(diǎn)還不足以解釋食管癌的總遺傳度。因此，在上述研究結(jié)果的基礎(chǔ)上，林東昕教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)繼續(xù)在食管癌GWAS數(shù)據(jù)中挑選10-7<　P?10-4的169個(gè)SNP，用Illumina　的Goldengate芯片進(jìn)行二期驗(yàn)證。在由8092食管癌病例和8620對(duì)照組成的兩期驗(yàn)證隊(duì)列中，又發(fā)現(xiàn)9個(gè)食管癌易感位點(diǎn)，其中7個(gè)位點(diǎn)(4q23,　16q12.1,　17q21,　22q12,　3q27,　17p13　and　18p11)顯示顯著的邊際效用，而另外兩個(gè)位點(diǎn)(2q22　and　13q33)則只在飲酒加入分析后才顯示其作用。發(fā)現(xiàn)位于染色體4q23的易感位點(diǎn)是代謝酒精的乙醇脫氫酶家族(ADHs)基因所在的區(qū)域，這些位點(diǎn)的變異與飲酒有顯著的交互作用。此外，應(yīng)用全基因組基因-環(huán)境交互作用分析方法，還重復(fù)驗(yàn)證出含乙醛脫氫酶基因(ALDH2)的12q24位點(diǎn)與飲酒的交互作用。聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn)，攜帶ADH1B和ALDH2危險(xiǎn)等位基因者如果飲酒，發(fā)生食管癌的風(fēng)險(xiǎn)比攜帶非危險(xiǎn)等位基因的4倍，而如果不飲酒，即使攜帶ADH1B和ALDH2危險(xiǎn)等位基因發(fā)生食管癌的風(fēng)險(xiǎn)也很小。這些結(jié)果十分清楚地顯示酒精代謝通路的基因變異與飲酒在食管癌病因中起重要作用。

　　目前這項(xiàng)研究共發(fā)現(xiàn)食管癌12個(gè)新的遺傳易感位點(diǎn)，分布于多個(gè)染色體區(qū)域。這些基因變異對(duì)增加食管癌的風(fēng)險(xiǎn)有累加作用，其中有的與吸煙和飲酒有顯著的基因——環(huán)境交互作用。這些結(jié)果揭示了食管癌的發(fā)生涉及多基因以及基因與環(huán)境之間的交互作用，對(duì)理解食管癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)理、對(duì)食管癌預(yù)警和早期診斷、預(yù)防都有重要的意義。此項(xiàng)研究成果是國(guó)內(nèi)外多家學(xué)術(shù)單位共同合作的結(jié)果，也凝聚著我院所林東昕教授課題組、詹啟敏教授課題組和劉芝華教授課題組的諸多努力;吳晨、翟侃、常江等多名博士研究生參與該研究，為完成該研究做出重要貢獻(xiàn)。　(分子腫瘤學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、病因及癌變研究室　譚文)