確診為神經內分泌功能失調所致的月經病，在治療上應根據病情的輕重及患者的具體情況，采用不同的治療方案。月經病給患者帶來的主要問題有以下幾方面，治療也要從解決病人的這些問題人手：
(1)出血與貧血：由于經期長及經量多造成。除一般止血措施外，可酌情選用激素或刮宮止血。
(2)周期紊亂：可采用雌激素、孕激素單一或聯合的周期治療，也可用中藥治療。
(3)不孕：下丘腦一垂體一卵巢軸中的一個或多個環節功能失調引起無排卵，是月經病的病理生理基礎之一，也是不孕的原因之一，是許多患者迫切要求解決的問題。有些患者雖然排卵但黃體功能不足，也能引起不孕。根據患者情況選擇不同的促排卵藥物，改善卵巢的功能或代替垂體及下丘腦的部分功能。