由于引起男性不育癥的原因很多，如先天發育異常、細胞遺傳染色體異常、下丘腦—垂體—性腺功能紊亂、內分泌功能失調、性機能障礙及生殖道感染，乃至心理因素等都可能是原因之一。
精液常規檢查
這是測定男性生育力的最基本、最重要的臨床指標，有關精液的參數是醫生最先需要了解的，患者要注意的是：檢查時3-5天不同房;較好用手淫方法取標本;要能保證獲得全部精液。
精漿生化檢查
對精漿的化學成分分析有助于對附睪、前列腺、精囊腺功能的了解?；颊哂芯毫可佟o精癥、少精癥、不明原因的精子活動力下降、附屬性腺先天缺陷及附屬性腺疾病等情況時，可做精漿生化檢查，常見有果糖、肉毒堿、酸性磷酸酶等。
相關微生物檢查
性泌尿、生殖系統感染常常導致男性不育，與男性泌尿、生殖系統感染有關的病原微生物有細菌、病毒、螺旋體、支原體、衣原體等，常見有淋球菌、乳頭狀瘤病毒、腺原體、沙眼衣原體等。
遺傳學檢查
男性相關染色體及基因的正常是維持正常生殖功能的基礎，染色體及基因的異常會導致性分化異常和(或)精子生成障礙，從而嚴重影響生殖功能。