癲癇發作常會給患者帶來極大的危害。主要有癲癇持續狀態、意外事故、自殺、不能解釋的突然死亡。全身性發作的癲癇持續狀態常伴有不同程度的意識、運動功能障礙，嚴重者更有腦水腫和顱壓增高表現。即使積極搶救，病死率仍達3。6%。同時，智力低下、癱瘓和更嚴重癲癇發作等神經后遺癥發生率高達9%~20%。因為癲癇的發作特點，即反復性和發作性，造成患者的隨時病發，也可能會使患者置于危險狀態。而也有患者忍受不了病痛折磨或者各種壓力而選擇了自殺這條不歸路。
另外，癲癇癥還有一種名為“癲癇猝死癥”的類型，事實上它的準確名稱應該是“癲癇不明原因突然死亡”，即無其他疾病的癲癇患者于一次發作后的1小時內(世界衛生組織建議為24小時之內)突然死亡，沒有導致突然死亡的合并癥，也非意外死亡或癲癇持續狀態。
外傷：患者在發作時可能會因為意識突然喪失而跌傷，觸及周圍硬物、銳器而對身體產生各種傷害。頑固性癲癇發作的患者，發作時更易情緒激動，可能發生自傷、傷人、毀物等過激行為。
癲癇性精神障礙：癲癇患者一旦被確診，必定會給他帶來很大的心理壓力，很多人或多或少會存在心理問題，常會有絕望心理。而頑固性癲癇的用藥期往往很長，部分患者可能要終生用藥，加之日常生活難免會發生各種各樣不順心的事情，特別是與疾病相關的事情，往往會加重患者的心理負擔，最終導致癲癇性精神障礙。
智力衰退：癲癇患者智力低下的發生率較正常人高，其中尤以頑固性癲癇居多。其原因主要是由原發病造成的腦損傷、腦功能紊亂，自然就會引起注意力不集中，定向力差，思維、理解、判斷、分析、計算、記憶等也不可避免地受到影響。藥物副作用：頑固性癲癇病的病程長，服藥時間自然會較長，用藥種類也可能會更多更雜，隨之產生的毒副作用也會更大，甚至在治療范圍內也能出現毒性反應。