牛痘疫苗性結膜、角膜炎多通過疫苗感染，即接種減毒牛痘疫苗，通過飛濺或手接觸等方式，誤將疫苗帶至眼部感染而發病。常見于小兒或醫務工作者，主要是未接種過牛痘或接種牛痘年代已久遠者。潛伏期一般在三天左右。癥狀一般來說比較輕，但亦有較為明顯者，由于毒素對血管內皮細胞的刺激，導致眼瞼腫脹、充血、逐漸加重，以致不能睜開眼睛。耳前淋巴腺可以腫大，瞼結膜形成被以白色偽膜的小潰瘍，周圍可以有增生的肉芽組織，球結膜充血，也可以有類似病損。約一周后潰瘍愈合，結成瘢痕樣變，也見有病程達二至四周的患者。
一般預后良好，較重病例，瘢痕較深，范圍較大的，可以引起瞼內翻，瞼球粘連等合并癥。除結膜病變外，患者還常伴有眼瞼、口、鼻部牛痘損害。
發生角膜病變者，可以呈現點狀侵潤、樹枝狀、地圖樣或盤狀角膜炎，甚至角膜膿腫、潰瘍等嚴重損害，此種情況多預后不良。
預防和治療措施為控制接種牛痘幼兒，不以手搔抓接種部位。醫務人員要小心操作，避免疫苗濺入眼內。治療應該及時抗病毒和抗炎治療，局部滴用抗病毒滴眼液和抗天花免疫血清。為預防繼發感染可以用抗生素眼藥、口服藥等，角膜炎患者可以按病毒性角膜炎進行治療，密切觀察恢復情況，必要時住院觀察治療比較妥當。