腎囊腫要與多囊腎相鑒別，多囊腎是一種遺傳性疾病，有家族遺傳史，但發病大部分是在成年后，以腎臟彌漫性小囊腫為特征，囊腔及腎臟體積逐漸增大，最終會引起腎功能衰竭。腎囊腫一般為單個或數個囊腫，可發生于單側，也可發生于雙側，一般不會引起腎功能損害，一般認為腎囊腫是一種退行性改變，隨著年齡的增加而發生，60歲以上老年人50%以上行B超檢查都會發現腎囊腫，一般不需要治療。除非囊腔巨大壓迫了周圍正常腎組織才需要外科治療。目前沒有證據證明中藥可以消除腎囊腫。