有人認(rèn)為，腹瀉必然是胃腸道細(xì)菌感染，因而一旦遇到腹瀉便使用抗生素來治療，如黃連素、慶大霉素、環(huán)丙沙星、氟哌酸等。

　　誠然，霍亂、痢疾和一部分由大腸桿菌感染所引起的腸炎，確實是細(xì)菌感染，治療時常常需應(yīng)用抗菌藥物。然而，腹瀉未必全是細(xì)菌感染胃腸道所致，如：腹部受涼引起腸蠕動加快;對乳品、魚、蝦及蟹等食物過敏引起腸的變態(tài)反應(yīng);胰腺外分泌功能不足，胰腺癌等;膽汁排出減少、雙糖酶缺乏使腸腔內(nèi)存在大量未經(jīng)消化而不能被吸收的溶質(zhì)，引起高滲性腹瀉;外出旅行或遷居外地生活，有的人因為生活環(huán)境的改變使腸道內(nèi)正常菌群的生活環(huán)境發(fā)生了變化，從而發(fā)生了“菌群失調(diào)癥”而引起的厭食、嘔吐、腹痛甚至腹瀉不止等癥狀;有些嬰兒因飲食不當(dāng)，輔食增加過快過多，造成的腹瀉等，舉不勝舉。諸如此類腹瀉便沒有細(xì)菌感染存在。還有些腹瀉，如嬰幼兒秋冬季腹瀉，成人和大孩子夏季“流行性腹瀉”和霉菌性腸炎等都不屬于通常所說的細(xì)菌感染。其中，嬰幼兒秋冬季腹瀉和夏季“流行性腹瀉”系病毒感染所引起，而霉菌性腸炎是由與各種普通細(xì)菌特性完全不同的一類霉菌引起的。既然病原不同，治療方法就不應(yīng)該完全相同，所以應(yīng)用抗菌藥物應(yīng)當(dāng)慎重。

　　許多抗生素，尤其是口服后，均可引起不同程度的胃腸道副作用，如惡心、嘔吐、腹瀉或食欲下降，甚至影響肝臟、腎臟和造血功能，其中以廣譜抗生素引起的胃腸道副作用較為嚴(yán)重。其原因，除化學(xué)刺激因素外(化學(xué)刺激性與劑量有關(guān))，廣譜抗生素可引起體內(nèi)的菌群失調(diào)而導(dǎo)致二重感染是另一個重要因素。

　　二重感染，亦稱菌群失調(diào)癥。在正常情況下，人們處于一個龐大的微生物生存的環(huán)境中，人體的皮膚粘膜和與外界相通的腔道，如口腔、鼻、咽、腸道等處，都寄生著一定數(shù)量的細(xì)菌，這些數(shù)量繁多的細(xì)菌，與人體既相互依存又相互制約，對人體不但無害，反而有益。其中腸道的正常菌群，在食物的消化吸收過程中起著重要的促進(jìn)作用，而且，腸道正常的菌群還對危害人體健康的致病菌有著強(qiáng)大的遏制作用，可以有效地遏制它們的生長繁殖，這對人體來說，是非常重要的，在醫(yī)學(xué)上稱為生態(tài)平衡。

　　抗生素特別是廣譜抗生素的應(yīng)用，往往使體內(nèi)各處的敏感菌受到遏制，而使耐藥菌乘機(jī)在體內(nèi)繁殖生長，導(dǎo)致二重感染。也就是說，本來用抗生素想殺滅致病菌，結(jié)果反遭致更厲害的細(xì)菌感染，其中，耐藥性金黃色葡萄球菌和革蘭氏陰性桿菌是二重感染的主要病原。由耐藥性金黃色葡萄球菌等所致的二重感染，主要形式為腸炎，可見，廣譜抗生素應(yīng)用過程中所引起的二重感染往往會加重腹瀉。

　　另外，廣譜抗生素的應(yīng)用使腸道內(nèi)很多細(xì)菌受到遏制，這些細(xì)菌中有些具有合成維生素 B族和維生素K的能力，因此，菌群失調(diào)后就可能導(dǎo)致維生素B復(fù)合物缺乏，可出現(xiàn)惡心、嘔吐、腹瀉等胃腸道癥狀。