急性期的嚴重并發癥主要有嚴重的循環充血狀態、高血壓腦病和急性腎功能衰竭。隨著近年防治工作的加強其發生率及病死率已明顯下降。
1、循環充血狀態：因水鈉潴留、血容量竭、直至肺水腫。發生率各家報道不一，與病情輕重、治療情況有關。臨床表現為氣急、不能平臥、胸悶、咳嗽、肺底濕羅音、肝大壓痛、奔馬律等左右心衰竭癥狀，系因血容量擴大所致，而與真正心肌泵竭不同。極少數重癥可發展至真正的心力衰竭，于數小時至1～2日內迅速出現肺水腫而危及生命。
2、高血壓腦病：指血壓(尤其是舒張壓)急劇增高，出現中樞神經癥狀而言。一般兒童較成年人多見。通常認為此癥是在全身高血壓基礎上，腦內阻力小血管痙攣導致腦缺氧腦水腫而致;但也有人認為是血壓急劇升高時，腦血管原具備的自動舒縮調節功能失控、腦血管高度充血、腦水腫而致此外急性腎炎時的水鈉潴留也在發病中起一定作用。多發生于急性腎炎病程早期，起病一般較急，表現為劇烈頭痛、頻繁惡心嘔吐，繼之視力障礙，眼花、復視、暫時性黑蒙，并有嗜睡或煩躁，如不及時治療則發生驚厥、昏迷、少數暫時偏癱失語，嚴重時發生腦疝。
3、急性腎功能衰竭：急性腎炎患兒相當部分于急性期有程度不一的氮質血癥，但進展為急性腎功能衰竭者僅為極少數。并發癥尚乏有效預防措施，已成為急性腎炎死亡的主要原因。臨床表現為少尿或無尿、血尿素氮、血肌酐增高、高血鉀、代謝性酸中毒。少尿或無尿持續3～5或1周以上，此后尿量增加、癥狀消失、腎功能逐漸恢復。
4、繼發細菌感染，急性腎炎由于全身抵抗力降低，易繼發感染，最常見的是肺部和尿路感染，一旦發生繼發感染，則應積極對癥處理，以免引起原有病加重。
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