恐懼癥的主要治療方法包括：行為治療、藥物治療和其他治療。
行為治療
許多患者在疾病過程中已經學會如何回避令他們產生恐懼的對象和場所而不影響他們的日常社會功能。行為療法是治療恐懼癥的優選方法。系統脫敏;療法、暴露沖擊療法對恐懼癥效果良好。基本原則一是消除恐懼對象與焦慮障礙反應的條件性聯系;二是對抗回避反應。但行為只強調可觀察到的行為動作，是治表未治本，療效是否持久，結論不一。
藥物治療
嚴格地說并無一種消除恐懼情緒的藥物，對單純恐懼一般沒有效果，但可用苯二氮卓藥物來暫時緩解單純恐懼，例如飛行恐怖。合用普萘洛爾為代表的β受體阻斷劑對恐懼癥的軀體癥狀效果很好，能減輕或者消除自主神經反應，如心悸、氣促、出汗等，降低警醒水平。SSRI類如帕羅西汀、舍曲林等治療社交焦慮障礙有效，但藥物的不良反應限制了應用。有文獻報道，丙米嗪對恐懼發作有時具有戲劇性效果。
其他治療
如氣功、松弛療法等也有一定的療效。