淚腺、淚道先天性異常有多種，如先天性無淚道、或淚管擴張，極為罕見，另外先天性無淚腺、先天性無淚液、先天性淚液分泌過多；食物時或味覺刺激時引起一側或雙側大量流淚，即所謂“鱷魚淚”，先天性淚腺異位，淚腺脫垂至上瞼內或伴有瞼皮膚松垂癥，先天性淚腺囊腫、先天性淚腺瘺等，但均極為少見。
先天性淚點閉鎖，此病不少見，淚小管正常，淚點開口較小或被上皮完全覆蓋，表現為一小凹陷或突起。淚點開口小者，可以用淚點擴大器反復擴大；無開口者，可以在瞼緣后面相當于淚小管部位切口，之后涂抹抗生素類藥膏鞏固治療即可；對于無淚小管者，一般多可以作結膜囊造口術治療，并定期的到眼科進行復查和鞏固。
額外淚點和淚小管，有時一個眼瞼有兩個或更多的淚點，有的各有一淚小管通入淚囊。部分病例有家族性。此種情況可以考慮做淚小點的封閉和阻塞治療，要結合自身的情況采取合適的治療方式進行干預。
先天性淚囊瘺，較為常見，可以出現單側或雙側，開口多位于鼻外側，在內眥韌帶下，與淚囊想通，常常流出清液。多數情況下，不排除有一定的感染存在，所以應該適當的給予抗生素眼膏或滴眼液進行抗炎治療，治療方面可以用熱烙或硝酸銀燒灼封閉瘺管，也可以行手術切除治療的。