衣原體性結膜炎是由衣原體感染引起，有兩類，即沙眼和包涵體性結膜炎，后者傳播途徑多與性接觸有關。沙眼是原發于結膜的慢性炎性疾病，曾在國內廣泛流行，近年來已經基本得到控制。
自覺癥狀一般較為輕微，甚至無不適感。通常癥狀是癢感、異物感、干燥感和燒灼感。當有合并癥時才出現不同程度的疼痛感、畏光、流淚、異物感和視力的減退等。
初期沙眼與一般非特異性慢性結膜炎相似。結膜下血管模糊不清，瞼板紋理不清，并有少量粘液分泌物、乳頭增生、濾泡形成和角膜血管翳等。痊愈過程中出現線狀、網狀瘢痕。乳頭增生表現為瞼結膜充血和粗糙不平，外觀呈紅色天鵝絨狀，乳頭小兒微凸起，好發于近內側，外眥及靠近瞼板上緣的瞼結膜。乳頭增生緣于慢性炎癥刺激反應，非沙眼的特異性病變。濾泡形成早期濾泡為輕度隆起或隆起不明顯的黃白色小點，大于乳頭、分布于瞼結膜，這種濾泡可以吸收消退，不留瘢痕。瘢痕的出現表明沙眼病變進入修復退行階段，表現為在充血、肥厚、乳頭增生的結膜內，有灰白色、黃白色細線，粗細不等。角膜血管翳是沙眼衣原體侵犯角膜的原發損害，是具有診斷意義的特異性表現之一。沙眼衣原體感染早期，除結膜受到侵犯外，角膜也可受到感染損害。開始在角膜上緣出現上皮下細胞浸潤，混濁呈小點狀。角膜血管翳因充血擴張程度不同，滲出浸潤多寡，病程長短，以及有無瞼內翻、倒睫、個體差異、眼干燥癥等的因素，在臨床上有不同表現和不同程度的危害。